Color variations between and within wheat plant

前几天，在微信公众号里看到有个R包（gganatogram) 可以画动物和植物的图形，但是里面的小麦不好看。于是把我用R画的小麦分享出来，比一比哪个更好看😜。

话不多说，先上图。

先说说为什么要画这么一个图。

那是在我刚进课题组的时候，就了解到实验室有大量小麦的数据。而且是从叶片到茎秆再到穗和籽粒等等各种器官一应俱全。更让人惊喜的是这些数据时间跨度大。当时我就在想，用什么样的方式才能展示出来这么丰富的空间和时间变化呢？

一次偶然的机会，我联想到地图，地图里面的各个区域由多边形组成，区域的数值变化可以通过填色来完成。眼尖的同学应该看出来了，里面正是我华北平原的吴桥实验站（手动笑脸）。

而我们一株小麦上的各个器官正好对应着地图上不同区域。利用小麦不同器官的轮廓图，勾勒出多边形，再把多边形组合，就形成一株完整的小麦。

有了这个想法之后，我就开始实施。首先从网上找到一株小麦的矢量图（就是各器官能分开的图形），然后根据各部分的轮廓创建多边形。是的，图形数据化用到了一款开源软件，名为WebPlotDigitizer。这款软件非常强大，可以提取图像或者图片中的坐标数据。这里特别提一句，小麦植株的比例做了一些微调，可能与真实的有点出入，但是不影响数据展示。还有一点，我们课题组专门研究地上部分的，暂时还没把根(器官)加进去，不过后期会考虑。

多边形创建采用了专门处理gis数据的R包sf。

最后的成品就是前面看到的这个样子了。每一个部分都可以根据自己的需求填上任意的颜色。而且颜色也可以根据需求自己选择，颜色的深浅代表指标的高低。

也可以给每个部分添加标签，放上对应的数据。这样看起来好是不是好很多。

再来一张动图看看。

最后公布一下gganotom R包里面的小麦。看起来也还行 😄